我们现代科学对根的定义：根是高等植物的营养器官，能够把植物固定在土地上，吸收土壤里的水分和溶解在水中的养分，有的根还能贮藏养料。植物生长于土中或水中吸收营养的部分。根，木株也。——《说文》
现在大多数资料对本的解释是，本的古字形在“木”的下部加一指示符号，标明树根的位置所在，本义指树根，又指草木的茎、干。又比喻根本的、重要的事物，跟“末”相对。又引申为主体、原来、本来、原始等意义。古文：楍、?。
根是从形上直观认识去草木等植物的，是形而下的。大部植物的根是在土中的，也有一部分植物的根在空气中，还有一部分植物的根在水中，比如南方常见的榕树除了土中有根，就有很多气根在空气中；而菖蒲的根在水中。
个人看法，“本”的含义应该主要是从功能上去认识草木等植物，是形而上，这样有助于理解“本”的真正含义。形而上不能脱离形而下，离于物的形而上，对人类的生存与发展没有任何实际意义，古人的观念是存而不论。形而上者，之为道；形而下者之为器。器是生化发生的地方，“是以升降出入，无器不有。故器者生化之宇”，植物的生生化化，发生在植物的根茎叶花果实。“本”是植物的处所，位，以及植物全体的有机联系的整体功能体现，而根只是一个植物的一部分，“本”的一部分。一个植物是从其处所，位，得到光照、热量，获取水、矿物质、营养成分，古人所谓天经地义应该指的就是这个。“本”既是指一个植物自身获取光照、热量，获取水、矿物质、营养成分的能力，即自身的性能；也是指其处所，位，能够提供给植物的光照、热量，水、矿物质、营养成分，满足植物生长需要的能力，即环境条件。这些个中之意可以在“本”的古字形木下面的口、点、三角等象形之中，可以略见端倪。
植物自身获取水、矿物质、营养成分的能力，既是与植物的种性即天性相关，但最终是由植物个体的特性即禀赋，一个植物个体自身的天命决定的。人参、党参、太子有种性之别，它们的“本”就会不同，即药性不同；十年的人参，百年的人参，禀赋的天命有别，它们的“本”也会不同。同样大小、年龄的人参，野生的与人工培植的，禀赋的天命有别，生长环境有别，它们的“本”也会不同。
处所，位，能够提供的光照、热量，水、矿物质、营养成分，是地理位置，经纬高下确定的。唐·柳宗元《种树郭橐驼传》：“凡植木之性，其本欲舒，其培欲平，其土欲故”。古人耕作制度有轮作休耕，也是为了保证庄稼能够得到充足的地力，《尔雅·释地》：曰：“田，一岁曰菑，二岁曰新田，三岁日畲。”。
植物个体的特性即禀赋，植物个体自身的天命，应该是古人所谓元者，乾元，元者善之长。所以古人嘉种，现代农业也要培育优良品种。古人对植物的期望和要求是元、亨、利、贞，是行健，是自强不息。
古人有“嘉种”的观念，体现在《大雅·生民》：“诞降嘉种，维秬维秠，维穈维芑”。秬（黑黍）和秠（一稃二米）是黍中的优良品种，穈（赤苗）和芑（白苗）则是粟中的优良品种。提出嘉种的目的是与选种有关。“生民”一诗中所谓“种之黄茂、实方实苞”即是对选种的描写，黄茂方苞，是说要求选择色泽鲜黄、肥大而又饱满的植物成实作种子。
古人选择种子还注重其在生长其间的表现，选择那些适时耕种、生长过程中茎叶茂盛、秋天收获的果实多、成熟饱满、皮薄糠少、食之香甘、使人肌泽且有力、忍饥耐饿，强身抗病的精品粮食作为种子，即乾道六象都能有正的性命的表现，人观察到的农作物生长阶段根、莖、葉、花、果、實都得有正、常的表现。《吕氏春秋》讲“其臭香，其味甘，其气章，百日食之，耳目聪明，心意睿智，四卫变强，气不入，身无苛殃”。
遗传的自然规律告诉我们，先辈有好的表现，后代大都会有良好的正传继承，所以古今的人们都有追远之举，其目的是慎终。善始才能善终。要想善终必须先来善始，都是在强调“本”。
处所，位，能够提供的光照、热量，是取决于地理位置，经纬，高下；水、矿物质、营养成分，土壤条件，这应该是古人所谓地势，坤。古人对地理条件的期望和要求，对坤来说是厚，是直、方、大，是利牝马之贞，是含章可贞。
植物的根、茎（干）、叶、花、果、实是生长过程中的阶段性具象，它们最终成形、盛衰，是由“本”的能力决定的。也就是说，人类稼穑最想得到的植物果、实的品质、数量，即古人所谓贞，是由“本”来决定的。《诗经·大雅·荡》：“枝叶未有害，本实先拨。”
草木的花、果、实、枝、叶、茎、干与根部连结在一起，是一个完整的有机体，植物的光合作是植物成长期生命力的体现。现代科学研究表明，植物的每一部分功能都与其生命力相关，缺一不可。光合作用在植物的叶发生，光合作用需要的水、矿物质、营养物质要靠植物的根系从处所，位，获得，这些物质传导到植物的叶要通过植物的茎、干、枝，它们是有机整体，它们功能正常，有所本，生命才能延续，某一功能失效，植物就会凋零枯萎，如果不能修复，植物就会死亡。
草木的根是草木生长的开始，“本”就指起始、根源。事物的根源往往决定了事物的性质，而事物的性质又是它的根源的反映，“本”字也因此带有原来的、固有的含义。草木的根起于种子。古人所谓元者善之长也。
元，即为天作之选、性本善的种子。元者善之长也，此之谓也。于四时为春；于农作物为种子；于本象为种子生根发芽。好的开始，好的开端，想要收获高产、上品的粮食，好的种子是重要保障之一。古人为慎终而追远。
在太和的自然状态下，天地賦予野生動植物自然化育的完美生命和果实，人食用品尝后选取口味香甘、抗饿耐饥、强身防病的上品成实作为种子。天作之选，此之谓也，天作人选，神农尝后之所得也；性本善，此之谓也，农作物的本性必须得是善的。
《纲鉴易知录》记载：“民有疾，未知药石，炎帝（神农）始草木之滋，察其寒、温、平、热之性，辨其君、臣、佐、使之义，尝一口而遇七十毒，神而化之，遂作文书上以疗民疾而医道自此始矣”。植物草木的酸、苦、甘、辛、咸、淡之味，寒、热、温、凉、平之性是草的性质，治疗疾病是其功能，人类利用草治病也是用植物之“本”，《神农本草经》中“本”的含义想必也是源于此的。
植物的生长化收藏，归根到底是物质运动和能量运动。能量运动的变化，其主要源自日、月、五星等近地天体的周期性运动对地球及其承载的万物的影响。中国古代文化的八卦、易经、阴阳、五运就是为了满足农业生产的需要，伏羲、神农等先贤对植物生化的能量变化和物质运动，不断认识和归纳总结，所取得的文明成果。